仪器仪表
实验室里,经常被人抢破头的仪器!
2023-08-18 17:36  浏览:26

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你好呀,这里是食分有趣!我是小安老师~
今天讲讲分子生物学研究中最常用的手段:核酸凝胶电泳
这个“最常用”绝对当之无愧,我们实验室的十几台电泳仪没有一分钟是闲着的,我总怕有一天会上演几人因电泳仪而大大出手的画面~~
核酸凝胶电泳是用于分离核酸(DNA或RNA)的一种传统手段。
由于核酸在中性pH值下带负电荷,在外加电场的作用下会向负极迁移。
在多孔介质中,不同分子量的核酸分子因迁移速率的不同而分离开来。
当不同分子量的核酸结构相似时,其碱基数与迁移距离成反比
电泳中核酸碱基数与迁移距离的关系图
核酸电泳常用的多孔介质有两种:琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶,二者最大的不同是对于分离核酸分辨率的差异。
琼脂糖凝胶更适合区分分子量较大的核酸分子,分辨率为200~50,000 bp。琼脂糖凝胶电泳通常使用水平方向的电泳设备。
凝固后的琼脂糖置于电泳缓冲液中,当样品添加到凝胶孔中时,其中的核酸向正极水平移动,分子量较小的核酸会跑在前端,将分子量较大的核酸落在后面。
琼脂糖凝胶电泳装置
聚丙烯酰胺凝胶更适合区分分子量较小的核酸分子,寡核苷酸一般也采用此方法进行分离,其分辨率通常为1~1000 bp。
聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electrophoresis,简称PAGE)通常使用的是垂直向的电泳设备,样品由凝胶上端的孔中加入,其中的核酸则向下迁移,当然此时设备底端是接着正电极的。
聚丙烯酰胺凝胶电泳装置
核酸本身是没有颜色的,因此在电泳过程中无法看到。为了能观测电泳的进程,通常在电泳时样品会与一种蓝色的loading buffer混合。
这样,在电泳中,蓝色的loading buffer也会向正极迁移,从而指示电泳的进程。
在电泳结束后,取下的凝胶通常会使用荧光染料对凝胶中的核酸染色,荧光染料一旦与核酸结合则会发出荧光,当使用凝胶成像仪对凝胶进行拍照时,则可清晰看到核酸的条带。
还有一种更加简便的预染料也被经常使用,它只需要在配置凝胶时加入凝胶中,这样电泳中的核酸就可直接被染料结合,而无需电泳之后再进行染色。
凝胶成像仪拍得的电泳图(最右边为ladder)
如何判断样品中核酸的大小呢?
电泳时常用ladder来指示核酸的大小。
Ladder就是将一系列已知长度的DNA混合在一起,在电泳时,他们就会按照大小一一排好,这样未知长度的核酸与ladder中已知长度的条带对比一下,就可以获知核酸的大致长度啦。
本次的仪器介绍就到这里啦,你还有什么想学的知识点欢迎发消息告诉我,下期见!
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