来源:IVD研究社 作者:黄工 文章原标题:“一文盘点:微生物培养、鉴定与药敏分析仪器、试剂和耗材”
国内临床微生物检测产业,近二十年来取得很大发展。从手工到半自动单机,再到全自动单机、流水线,国产厂家在崛起。
微生物检验仪器,在所有IVD仪器序列中,自动化发展是较慢的一支。因为微生物标本来源丰富、种类多样、采集容器各异,在过去几十年里,很难建立统一的检测标准。检测标本有呼吸道、肠道、生殖道、无菌体液、组织标本等各种类型,与标本对应的前处理流程和培养基种类差异也很大。
近年来,随着各类信息技术和先进制造工艺,与微生物检验技术的交叉渗透,微生物检测仪器变得更加先进了。和其他IVD仪器一样,微生物检测仪器,同样经历了从手工、半自动,到全自动、流水线、智能实验室的发展阶段。
和生化、免疫 、分子、血球等常规仪器不同的是,微生物检验仪器,检测标本是微生物,而非人体细胞及细胞内物质。检测对象不同,检测方法也随之而异。《临床检验装备大全:仪器与设备》指出,引起人类感染的病原微生物,包括8大类:真菌、细菌、放线菌、支原体、螺旋体、立克次体、衣原体、病毒。前6种可用培养方法检测,根据临床需要做药敏试验;后2种难培养或不能培养,需用免疫学、分子生物学方法检测。见图1。
△图1:人间传染的病原微生物8大类
微生物诊断产品,都有哪些?黄工综合行业标准、教材研报、业内文章,画了一张《微生物诊断产品系统图》(图2)。根据《临床微生物检验基本技术标准》(WS/T 805—2022),以及临床微生物专家观点,微生物检验技术,分成四大类:染色镜检;微生物培养、鉴定和药敏检测;免疫学检测;分子生物学检测。
△图2:主要的微生物诊断产品系统图
微生物检验仪器,主要解决:标本中,有无目标微生物?有的话,是哪一种,药物敏感性如何?(一)按检测方法学划分,有8大类,见图2。包括:自动标本前处理系统、血培养/微生物培养系统、微生物鉴定药敏分析系统、飞行时间质谱鉴定系统、分子检测系统、免疫分析系统、厌氧培养装置、自动染色仪。当然还有配套的,培养瓶、培养基、药敏测试板卡等耗材及相关检测试剂盒。(二)按NMPA医疗器械注册法规,传统微生物检测仪器分8大类。包括产品描述、预期用途、注册名称、管理级别等,见图3。
△图3:微生物分析设备注册编码及分类
2022年11月2日发布的《临床微生物检验基本技术标准》中,明确微生物检验基本技术包括染色技术、显微镜检查技术、接种技术、培养技术、鉴定技术、分子检测技术和免疫学检测技术等。以下图4、图5,是对分子、免疫检测技术特点的概述。
△图4:用于微生物分子检测的技术类型和技术特点
△图5:微生物免疫学检测的标本类型、检测方法及技术特点
前面对微生物检验仪器,作了概览介绍。下文主要介绍,血培养仪、微生物质谱仪、微生物鉴定与药敏分析仪、微生物流水线四类产品。对其他微生物检验仪器,作简述。每一类仪器,尽可能包括:仪器发展简史及代际分布、仪器技术原理简述与分类、仪器构造和系统组成、国内外主要厂家及产品型号。这里主要讲临床应用方向,其他的如工业应用领域:食品安全监测、环境卫生检测等,暂不陈述。
行业标准YY/T 0656-2008 《自动化血培养系统》规定,自动化血培养系统,是指用于临床实验室,在体外对人体血液或其他无菌体液中的微生物,连续培养、自动检测和判断培养结果(阳性或阴性)的系统,该系统包括血培养仪及其相配套的培养基。
自第一代血培养仪发布至今,已过去55年,现今发展至第三代了。55年来,血培养仪在三个方面经历了,观察指标从肉眼到放射性标记、非放射性标记,仪器操作从手工到半自动、全自动,结果判断从终点到连续判读、能记录细菌生长曲线、出现阳性结果可随时报告等几个阶段。在全球血培养仪品类中,占据垄断地位的,是美国BD和法国生物梅里埃。
血培养仪工作原理是:自动监测培养基(液)中的混浊度、pH、代谢产物CO₂浓度、荧光标记底物或代谢产物等的变化,定性检测微生物的存在。按检测原理不同,可分为比色法、荧光法、气压法、电极法四种。这几种方法,都是非穿刺检测。前两种检测方法,均是监测细菌生长产生的CO₂,引起培养液中的pH值变化,从而引起颜色变化或荧光变化。气压法,是监测微生物生长过程中气体的产生和消耗,带来培养瓶气压的变化。
仪器培养的同时,每间隔一定时间,实时检测分析颜色、荧光、压力和电压的变化,绘制生长曲线,当检测值超过阈值,仪器自动报警,作为可能的阳性标本。当标本连续检测规定的天数,无阳性报警,则报告阴性。
一般来讲,血培养仪包括2大核心系统,恒温孵育系统和检测系统。前者要确保,培养系统中,温度波动不超过3℃。而检测系统,则是在培养瓶底部或顶部,安装有物理传感器,如光电传感器、气体传感器、压力传感器等,将模拟量转为数字量。
△视频:迈瑞医疗 全自动血培养系统 TDR-120
国外在20世纪60年代开始,研发自动血液培养系统。第一代血培养仪,以放射性核素测定,由于环保和安全性考虑,现已停止使用。第二代血培养仪,采用红外线检测瓶内CO₂气体含量变化,还需注入新鲜气体,存在敏感性低、交叉污染等问题,先较少使用。第三代血培养仪,采用更敏感的荧光和显色技术,同时将培养箱、搅拌系统和检测系统合为一体,克服了前两代诸多问题,受到临床很大的欢迎。
1968年,美国BD公司生产出,世界上第一代半自动血培养仪 BACTEC 110。1980年,美国BD又推出,世界上第一台半自动结核分枝杆菌检测仪 BACTEC 460。1982~1994年,美国BD相继推出,BACTEC 9120/9240及9050全自动血培养系统。同一时期,荷兰欧加侬公司(Organon Teknika)推出,BacT/Alert 120全自动血培养系统,MB/BacT全自动结核菌培养系统。法国生物梅里埃推出,Vital全自动血培养系统。
法国生物梅里埃踩在20世纪的尾巴,于1998年收购了欧加侬公司,推出全新的BacT/Alert 3D全自动血培养/分枝杆菌培养仪。2008年,美国BD推出新一代血培养仪BACTEC FX;2014年,又推出BACTEC FX40,适合基层使用且可模块化联机。美国赛默飞Thermo Fisher则靠收购,拥有了自己的微生物培养和药敏鉴定系统:VersaTREK240(台式)、VersaTREK528(立式)。
以上是国外微生物培养系统主要里程碑。而在国内,同样有一批企业,投身于血培养仪的开发报证和临床应用。到2023年8月底,已获批NMPA注册的血培养/微生物培养系统,共有45个注册证。来自28个国内外厂家,共计99个型号。其中,珠海迪尔、长沙天地人(深圳迈瑞)、珠海美华、山东鑫科,在国产厂家中型号数量靠前。血培养仪厂家,主要分布在广东珠海、湖南长沙、河南郑州、山东等地。尤其是珠海,可谓是国内微生物诊断产业重镇。
△图6:国内血培养/微生物培养仪厂家和型号列表
另外,还有与培养仪适配的重要试剂/耗材:培养瓶(图7)。主要类型有:需氧培养瓶、厌氧培养瓶、分枝杆菌/真菌培养瓶、双相血培养瓶、儿童血培养瓶等。培养瓶的核心组成,有两大部分:内置培养基和传感器,当然还有瓶身、瓶塞、瓶盖等。常见地,培养瓶材质有:PMMA(有机玻璃)或PC材质(聚碳酸脂)等,耐磨、耐高温、耐刮花、耐正负压强,还可透过透明罐身,观察培养皿生长情况和罐内气体环境变化。培养瓶平底,一般是平底、圆底类型。培养瓶内,主要是复合氨基酸和碳水化合物组成的培养基,以及O₂、CO₂、N₂混合气体填充。
△图7:国内外部分培养瓶图片(图源企业官网)
据笔者不完全统计(图8),到2023年8月底,国内外获NMPA批准的培养瓶厂家,共63个注册证。来自27个国内外厂家,共59种型号。培养瓶主要注册地在上海、郑州、珠海。
△图8:国内外血培养/微生物培养瓶厂家和型号列表
质谱仪特别是MALDI-TOF,在大分子生物标志物检测中,包括蛋白质、核酸、脂类等,展现很大潜力。由于蛋白质在细菌体内含量较高,因而生物质谱仪可用于细菌属、种、株的鉴定。通过生物质谱,得到每种细菌唯一的肽模式或蛋白质指纹图谱(PMF)鉴定细菌。
MALDI-TOF,中文全称为:基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析技术。主要工作原理为:将待测样品与能强烈吸收激光的基质配成溶液,溶剂发挥后形成的“固体溶液”进入离子源,激光照射“固体溶液”,基质吸收能量并传递给样品形成离子,样品离子进入飞行时间质谱仪中进行检测。基本结构包括:真空系统、电离源、飞行时间质量分析器等。见图9。
△图9:MALDI-TOF原理图示(来源:IVD老崔)
△视频:安图生物 微生物质谱检测系统 Autof ms2000
△视频:德国布鲁克 微生物质谱仪MALDI Biotyper
微生物质谱,商业化发展颇不易。早在1975年,ANHALT等利用质谱仪,结合高温裂解技术首次完成了细菌鉴定,由此拉开了质谱鉴定细菌的序幕。但直到2012年,法国生物梅里埃率先拿到FDA微生物鉴定认证后,飞行时间质谱仪才迅速在临床铺开。德国布鲁克随后推出自研微生物质谱仪MALDI Biotyper。生物梅里埃的VITEK-MS,最初来自日本岛津的Axima质谱仪,其微生物数据库SARAMIS由德国Anagnos Tec开发。
这两款产品,是微生物质谱仪的经典之作,总价都在200万人民币以上。据业内人士估算,国内微生物质谱仪潜在购买量,在4000台左右。按每台200万元售价计算,这将是个80亿元的大市场。为此,国内诸多质谱或传统微生物鉴定厂家,直接开发或OEM质谱仪,放弃传统微生物鉴定仪研发,期望“弯道超车”。这一发展态势,在2017-2018年,迎来高潮。
2017年4月,美国临床与实验室标准化协会CLSI,发布了史上第一版使用MALDI-TOF-MS鉴定微生物的指导文件《CLSI M58》。作为临床微生物界最权威标准化机构,出台这一指导性文件,既是对质谱技术用于微生物鉴定的专业认可,也对推动微生物质谱市场规范发展有重要意义。同年下半年,安图生物、禾信仪器、东西分析仪器先后发布微生物质谱仪,随后一两年,复星诊断、美华医疗、迪尔生物等,也发布了微生物质谱仪。
△图10:2大经典微生物飞行时间质谱仪(图源企业官网)
据不完全统计,到2023年8月底,国内获NMPA批准的微生物质谱仪,共有国内外15个厂家,共计33个型号。注册地,分布在北京、广东、河南、重庆等地。
△图11:国内微生物质谱仪厂家和型号列表
血培养仪,回答标本中,有无微生物的问题。微生物质谱仪,回答标本中,有没有以及是哪一种微生物的问题。临床微生物检测的最终目标,是治疗。因此,还需要知道,检测出的微生物,其药物敏感性如何。即通过药敏分析系统,得出微生物最低抑菌浓度值(MIC),根据CLIS的标准,得出相应药物敏感度:敏感S、中介I、耐药R三个结果。
传统微生物鉴定仪原理,基于微生物标本各自的酶系统不同、新陈代谢的产物不同,以及相应底物生化反应的颜色变化不同,进行区分。一般来说,有四种技术:光电比色法、荧光法、数码鉴定法、质谱法。微生物鉴定和药敏分析系统,具体的工作原理及流程,可通过下方两个视频详细了解。
△视频:迈瑞医疗 微生物鉴定药敏分析系统 AF-600
△视频:迪尔生物 细菌鉴定及药敏分析系统 D2Mini
到2023年8月,国内获批NMPA注册的微生物鉴定和药敏分析系统,共有17家41个型号。从型号数量整体来看,还是上海、广东两地为主。上海以进口的微生物4大家,广东以迪尔、迈瑞两家为主。当然还有其他省市的也有获批。
△图12:国内微生物鉴定和药敏分析系统厂家和型号列表
抗菌药物敏感性试验,AST,简称药敏试验。是指在体外测定抗菌药物抑制或杀灭微生物的能力。通过药敏试验,可以预测抗菌药物临床效果,进而指导临床医生选择合适抗菌药物。微生物药敏检测方法学,主要有三种:纸片扩散法(KB法)、E试验法和稀释法。对应的试剂盒,有药敏条、药敏板等。
纸片扩散法,是指将含有定量抗菌药物的纸片,贴在已接种待检菌落的琼脂平板上,纸片中所含的药物吸取琼脂中的水分溶解后,不断向纸片周围扩散,形成递减的梯度浓度,在纸片周围抑菌浓度范围内,待检菌落生长被抑制,从而产生抑菌圈。抑菌圈大小,反映检测菌落对测定药物的敏感性。这是一种半定量方法。而E试验法,则是浓度梯度琼脂扩散试验。原理同扩散法。可直接测定受试菌的MIC。稀释法与E试验法,均可测定MIC值,是一种定量方法。
△图13:药敏纸片
国内外生产药敏纸片、药敏条、药敏板企业:
(1)国外:法国生物梅里埃、美国BD、英国Oxoid(被Thermo Fisher收购),美国贝克曼、意大利Liofilchem,印度Himedia等。
(2)国内:郑州安图生物、北京天坛药物生物公司、杭州微生物试剂公司、杭州滨和微生物、温州康泰生物、珠海迪尔生物、山东鑫科生物、上海星佰生物等。
另外,还有一些药敏试剂盒生产企业,总体以广东、河南、浙江三省为主。到2023年8月底,搜索NMPA注册证数据库,关键词:药敏试剂盒/药敏检测试剂盒,国内注册证78张。对这78张注册证,做些统计。发现,广东有32张,占41%;河南25张,占32%;浙江10张,占13%;其余省份占14%。注册证数前5的,是郑州安图生物、温州康泰生物、珠海银科医学、珠海迪尔生物、广东阳光生物。29家药敏试剂盒厂家名录,见下图。
△图14:国内药敏试剂厂家名录
以上是三类单机微生物检测系统。从注册证获批地、型号数量及交叉企业来看,法国生物梅里埃、美国BD医疗,是第一梯队,拥有丰富的微生物检测仪器、试剂和耗材综合解决方案。而赛默飞、贝克曼,在微生物领域不像其他IVD板块强势,更多靠收并购补齐产品线。国内的还是以珠海、郑州两地为主,主要企业,以安图生物、迪尔生物、长沙天地人、美华医疗、鑫科生物,在国内微生物检测领域,一直处于国产系统自研的探路者和中流砥柱的角色。
正是因为微生物种属株数量繁多,标本来源、培养基类型各异,检测流程繁杂:接种、涂片、染色、培养、鉴定和药敏试验,在流水线这一综合实力竞争领域,微生物的发展一直较为落后。目前市场主流的2大微生物流水线,是美国BD Kiestra TLA 和意大利COPAN WASPLab。流水线见下方视频。
国内推出的全自动微生物标本前处理系统,一些代表性的厂家及型号有:安图生物AutoStreak S1800,武汉迪艾斯PROBACT Plus-90/70/40,济南百博生物 ET-800+,山东朗迈生物LARK-3200等。
我们来回顾一下,微生物自动化的历史:
1996年,加拿大Dynaco公司推出第一台自动接种仪,以机械臂代替部分人工,推出微生物自动化进程。
2006年,意大利COPAN公司,推出微生物标本前处理系统WASP。
2006年,荷兰Kiestra公司,最先提出了临床微生物实验室全自动化的概念,并成功安装了全球第一套用于临床诊断的微生物流水线。
2010年,意大利COPAN公司改进升级,推出全自动微生物标本前处理和培养系统 WASPLab。
2012年,美国BD医疗收购荷兰Kiestra公司。
国内第一台微生物自动化系统及流水线装机历史:
2010年,国内第一台自动化微生物平板接种系统,法国生物梅里埃 Previ ISOLA,在广州医科大学第一附属医院装机。
2012年,国内第一台全自动微生物标本前处理系统,意大利COPAN WASP,在西京医院装机。
2014年,国内也是亚洲地区第一套全自动微生物标本前处理和培养系统,意大利COPAN WASP Lab,在西京医院装机。
2015年,美国BD 全自动微生物标本前处理系统Kiestra InoqulA,第一台在广州医学院第三附属医院装机。
2019年,国内第一套微生物流水线美国BD Kiestra TLA,在四川大学华西医院装机,并于2020年3月正式启用,同时也是东亚地区首套全面投入临床应用的微生物流水线。
以上都是国内的流水线和自动化系统,而国产的则较为落后。为此,今年4月16日,“十四五”国家重点研发计划“病原微生物检测流水线全自动化系统研发”项目研讨会,在珠海美华医疗总部召开,正式开启国产微生物流水线研发进程。另外,5月31日,中国医学装备协会检验医学分会、中华医学会检验医学分会,发起《中国临床微生物实验室自动化应用及发展专家共识》项目,项目启动会在成都举行。在这里我们能看到,国内微生物流水线发展,的确要比国外慢近20年。未来之路,道阻且长啊,还需加倍努力。
△视频:微生物流水线美国BD Kiestra TLA
△视频:微生物标本自动化前处理和培养系统
意大利 COPAN WASPLab
参考资料目录:
1.《临床检验装备大全:仪器与设备》,科学出版社
2.《中国体外诊断产业发展蓝皮书》,2015-2020年卷
2.《临床检验仪器(第3版)》,中国医药科技出版社
3.《临床检验仪器与技术》,人民卫生出版社
4. WS/T 805—2022《 临床微生物检验基本技术标准》
5. YY/T 0656-2008 《自动化血培养系统》
6.相关企业官网、文章等
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